靶标钓取（target fishing），是指利用已知靶标的小分子药物库，通过结构相似性、化学环境的相似性等匹配原则，计算目标小分子与库中各药物的匹配得分，进而预测目标小分子的靶标。一个明确的药物靶标是后续药物构效分析、药物机机理解释、苗头化合物筛选、先导物化合物设计等的重要基础。在药物设计及生物医药相关的研究中
2022-01-07 【珠海市检验检测常见问题】 Tags： 珠海市分析仪器 珠海市计算机辅助药物设计 珠海市靶标钓取
分子对接（molecular docking）是指利用“锁钥原理”搜索配体结合到受体上时最佳的结合构象。分子对接可评价药物等配体与受体的亲和力大小，并分析他们的结合模式。是一种基于结构的药物设计方法，在酶学研究及药物设计领域有着广泛的应用。主要包括：小分子抑制活性、催化结合构象、蛋白-蛋白相互作用等。实验项目：1.小分
2022-01-07 【珠海市检验检测常见问题】 Tags： 珠海市分析仪器 珠海市计算机辅助药物设计 珠海市分子对接
虚拟筛选（virtual screening），即利用化学信息学建立药物活性与化合物结构的关系，并从待筛选库中筛选潜在活性小分子的方法，是目前广泛应用的药物计算方法。通常的筛选方法有类药性筛选、相似性筛选ADMET筛选、基于分子对接的虚拟筛选和药效团筛选等等。筛选规则：在药物的虚拟筛选中，常常需要考虑类药性等基本筛选条件
2022-01-07 【珠海市检验检测常见问题】 Tags： 珠海市分析仪器 珠海市计算机辅助药物设计 珠海市虚拟筛选
拉氏构象图，根据蛋白质中非键合原子间的最小接触距离，确定哪些成对二面角（Φ、Ψ）所规定的两个相邻肽单位的构象是允许的，哪些是不允许的。可用来鉴定蛋白质构象是否合理。常常作为同源模型的评价指标。
2022-01-07 【珠海市检验检测常见问题】 Tags： 珠海市分析仪器 珠海市计算机辅助药物设计 珠海市拉氏构象图
同源建模（homology modeling），即将一个与目标蛋白具有良好同源性的蛋白的三维模型作为模板，预测目标蛋白的三维结构。蛋白质三维结构作为基于结构的药物设计和理解其生物学功能的重要基础，具有不可替代的作用。但目前蛋白晶体结构数据库中的已知蛋白晶体结构有限。同源建模构建蛋白的三维结构，具有良好的可信度，是目前
2022-01-07 【珠海市检验检测常见问题】 Tags： 珠海市分析仪器 珠海市计算机辅助药物设计 珠海市同源建模
分子动力学模拟（molecular dynamics simulation）是一种基于物理、化学、数学等学科，模拟粒子体系的微观运动的方法。在流体动力学、新材料、生物医药等方向应用较多。在药物设计中可用于药物与受体相互作用分析、结合能计算，抑制剂构效关系分析、受体氨基酸突变研究、大分子变构调节机制研究等等。常用分析：1.模型稳定性
2022-01-07 【珠海市检验检测常见问题】 Tags： 珠海市分析仪器 珠海市计算机辅助药物设计 珠海市分子动力学模拟
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