【计算机辅助药物设计】分子对接

时间:2022-01-07 16:21:05来源:赵云经理

分子对接(molecular docking)是指利用“锁钥原理”搜索配体结合到受体上时最佳的结合构象。分子对接可评价药物等配体与受体的亲和力大小,并分析他们的结合模式。是一种基于结构的药物设计方法,在酶学研究及药物设计领域有着广泛的应用。主要包括:小分子抑制活性、催化结合构象、蛋白-蛋白相互作用等。

实验项目:

1.小分子/多肽-蛋白  对接

主要用于蛋白酶抑制剂设计,包括:

1)抑制剂活性预测

2)蛋白-抑制剂相互作用机理解释

3)抑制剂构效关系分析

4)关键氨基酸分析


2.小分子/多肽-RNA/DNA  对接

主要用于核酸抑制剂设计,包括:

1)抑制剂活性预测、结合机理解释

2)抑制剂构效关系分析

3)关键碱基分析


3.蛋白-蛋白  对接

主要用于蛋白抑制剂、免疫共沉淀,包括

1)蛋白-蛋白相互作用分析

2)关键氨基酸分析